Organização e apoio
Apoio Financeiro / Patrocínio
Por favor aguarde...
Minicursos ofertados durante o evento
Os minicursos serão ofertados mediante a disponibilidade mínima de oito pessoas pessoas. Todos os minicursos têm limite de vagas.
O sequenciamento em larga escala na era do NGS (Next Generation Sequencing) permitiu análises eficientes de transcriptomas. As abordagens atuais para a reconstrução de transcritos a partir de tais dados baseiam-se no alinhamento e posterior montagem das reads utilizando genomas de referência, quando disponível ou por meio de montagens de novo (sem genoma de referência). No presente minicurso serão analisadas as principais estratégias para montagem, bem como os principais passos metodológicos para a reconstrução de transcriptomas, especialmente na ausência de um genoma de referência
O desenvolvimento das técnicas de sequenciamento de última geração (Next Generation Sequence – NGS) viabilizou a obtenção de dados genômicos a um custo relativamente baixo e em um curto intervalo de tempo, revolucionando as pesquisas conduzidas nos campos da genômica, transcriptômica, biologia evolutiva e de sistemas, com impactos diretos em várias áreas de conhecimento. Sequências confiáveis ??de genoma completo são importantes para análises funcionais, além de fornecer a base para diversas análises. Nesse minicurso serão abordados tópicos que compreendem o uso de algoritmos na recuperação de dados, avaliação de qualidade e filtragem de reads, montagem de genomas de novo e por referência, predição e anotação funcional e genômica comparativa.
O Sequenciamento de Nova Geração (NGS) tem possibilitado uma produção sem precedentes de dados genéticos. A análise subsequente desses dados, em busca de variantes genéticas que possam estar associadas a determinado fenótipo, é um importante passo para novas alternativas de diagnóstico e tratamento personalizado de pacientes. Este minicurso visa introduzir como é feito o tratamento dos dados de NGS advindos de DNA humano por meio de ferramentas de bioinformática, passando pelas etapas de análise de qualidade, alinhamento, chamada e anotação de variantes.
Atualmente, com os avanços tecnológicos, diversas técnicas experimentais para o estudo de sistemas biológicos possuem a capacidade de produzir uma quantidade massiva de diferentes tipos de dados. Faz-se necessária a integração destes dados para que os mesmos se transformem em informação e conhecimento. Assim, o presente minicurso irá introduzir aos estudantes quais os tipos de dados mais comumente gerados na atualidade, algumas formas de integrá-los e a utilização de abordagens holísticas dentro da área de Biologia de Sistemas para o estudo e entendimento dos sistemas biológicos.
A parte teórica do minicurso consistirá em tópicos introdutórios de metagenômica, tais como aplicações, estratégias e ferramentas utilizadas para estudos taxonômicos em comunidades microbianas. A parte prática irá abordar análises estruturais e métodos estatísticos para comparação dos agrupamentos de OperationalTaxonomicUnits (OTUs).
Desde seu desenvolvimento (ainda nos anos de 1970), os métodos de sequenciamento têm evoluído rapidamente, principalmente nas últimas décadas, por se tratar de uma alternativa poderosa para estudos de genômica estrutural e funcional. Inovações nessa área incluem as tecnologias NGS - Next Generation Sequencing, as quais têm sido fundamentais para o avanço no sequenciamento amplo de genomas, acelerando o ritmo com que os genomas são explorados, além de proporcionar o ressequenciamento genômico e análises amplas sobre os transcriptomas de qualquer organismo. Com base na sua importância para as diferentes áreas do conhecimento, neste minicurso serão discutidos os fundamentos e evolução das principais plataformas NGS, assim como suas aplicações na área biológica.
Com o advento do sequenciamento de nova geração (Next GenerationSequencing – NGS), o grande desafio dos usuários é em relação à manipulação e análise dos dados. Desta maneira, o objetivo deste minicurso é identificar e caracterizar genes e proteínas, de acordo com sua estrutura, organização e função no genoma. Serão realizadas predições automáticas e buscas ontológicas com base em banco de dados especializados. Além disso, haverá a interpretação e execução de análises in silico do perfil de expressão gênica.
O curso pretende fornecer subsídios teóricos e práticos para determinação de estruturas biomoleculares com métodos computacionais. Haverá uma introdução sobre os aspectos fundamentais para o dobramento de proteínas, sobre técnicas de modelagem comparativa de pequenas proteínas, bem como definição dos requisitos para uma boa modelagem. Para isso, diversas ferramentas disponíveis em bioinformática estrutural serão aplicadas, além do uso de software para visualização das proteínas modeladas. O curso terá uma abordagem teórica seguida de algumas práticas de modelagem por homologia e visualização em software.
Recomenda-se trazer o notebook, e se possível já ter instalado softwares de visualização de arquivo .pdb (ex: chimera, pymol, vmd, noc).
O minicurso pretende introduzir o participante nas principais opções e ferramentas de anotação funcional. Abordará os diversos tipos de bancos de dados, entre nucleotídeos, proteínas e banco de artigos, discorrendo sobre seus formatos e possibilidades. Algumas ferramentas disponíveis serão citadas no intuito de oferecer uma visão geral das suas funcionalidades.
Entre as ferramentas, o BLAST será discutido e apresentado também em exercício prático, no qual o aluno poderá descobrir a ferramenta, orientado pelo ministrante, bem como compreender seus resultados.
Entre em contato conosco e envie suas dúvias e sugestões.